Thứ trưởng thường trực Bộ Ngoại giao Bùi Thanh Sơn làm Trưởng Ban Tổ chức.
2 Phó Trưởng Ban Tổ chức gồm: Phó Chủ nhiệm Văn phòng Chính phủ Nguyễn Xuân Thành; Trợ lý Bộ trưởng, Vụ trưởng Vụ Tổng hợp Kinh tế, Bộ Ngoại giao Nguyễn Văn Thảo. Các thành viên là đại diện các Bộ, ngành, địa phương và các cơ quan có liên quan.
Ban Tổ chức có chức năng, nhiệm vụ tham mưu, giúp Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo quá trình chuẩn bị và tổ chức Hội nghị WEF ASEAN 2018; phân công, đôn đốc và phối hợp hoạt động của các Bộ, ngành, địa phương và doanh nghiệp liên quan trong quá trình chuẩn bị, tổ chức hội nghị.
Ban Tổ chức gồm 5 Tiểu ban: Tiểu ban Nội dung; Tiểu ban Lễ tân; Tiểu ban Vật chất và Hậu cần; Tiểu ban Tuyên truyền - Văn hóa; Tiểu ban An ninh và Y tế và Ban Thư ký.
Ban Thư ký do Bộ Ngoại giao chủ trì, là Bộ phận thường trực của Ban Tổ chức đặt tại Bộ Ngoại giao, có nhiệm vụ giúp Trưởng ban Tổ chức đôn đốc và phối hợp hoạt động của các Tiểu ban.
Trưởng Ban, Phó Trưởng Ban, Trưởng các Tiểu ban và các thành viên Ban Tổ chức làm việc theo chế độ kiêm nhiệm; được sử dụng bộ máy, nguồn lực của cơ quan, đơn vị mình để tổ chức thực hiện nhiệm vụ được phân công.